Nella stagione 2016/2017 Mkhitaryan fu protagonista con il Manchester United vincendo l'Europa League contro l'Ajax. L’armeno fu decisivo in finale, andando in gol insieme a Pogba. E il giallorosso ha voluto ricordare la vittoria del trofeo sul proprio profilo Instagram, mettendo un pensiero anche per suo papà: “Questo gol, questa vittoria fu per mio padre"
